Program a sborník abstraktů
Podrobný program a sborník abstraktů 6. neformálního proteomického setkání lze nalézt pod tímto odkazem
Sborník NPS2019 (aktualizováno 27.11.2019, 17:05)
V případě, že ve sborníku naleznete nějakou zásadní chybu, dejte nám vědět emailem na adresu
"info (zavináč) czproteo (tečka) cz"
Děkujeme.
Součástí programu bude vyhlášení vítěze soutěže o Cenu Josefa Chmelíka za nejlepší českou proteomickou publikaci v roce 2017 a 2018.
Program v přehledu:
(aktualizováno 27.11.2019, 16:35)
Pátek, 29. listopadu 2019, 15:00 – 22:00
| 14:30 – 15:00 | Příchod a potvrzení registrace |
|---|
| 15:00 – 15:10 | Zahájení |
|---|
| 15:10 – 16:10 | Přednášková sekce I (předsedající: P. Řehulka) |
|---|
| 15:10 – 15:25 | P 01: O. Vít – Strategie “Pitchfork” a její využití v hledání nových zásahových míst v membránovém proteomu feochromocytomů a paragangliomů |
|---|
| 15:25 – 15:40 | P 02: J. Kislinger – Fibrilární struktura Amyloid Beta Proteinu pomocí SAXSt |
|---|
| 15:40 – 15:55 | P 03: T. Oždian – Mohou být slzy použity jako zdroj proteinů z mozku? |
|---|
| 15:55 – 16:10 | P 04: M. Némethová – Využitie LCMS proteomickej analýzy vo výskume ischemického poškodenia a ischemickej tolerancie v mozgu potkana |
|---|
| 16:10 – 17:00 | Miniprezentace – blok 1 (Předsedající: M. Šebela) |
|---|
| M 01: T. Hrdinová – Protein IFITM3 v exosomech z CML buněk jako potenciální marker rezistence na inhibitor tyrozin kináz – imatinib |
|---|
| M 02: D. Lipcseyová – Proteomická analýza mozkomíšního moku pacientek s roztroušenou sklerózou – cesta k identifikaci biomarkerů? |
|---|
| M 03: J. Faktor – Hmotnostne spektrometrická identifikácia mutovaných peptidov s potenciálom v protinádorovej vakcinácii |
|---|
| M 04: L. Janáčová – SWATH-MS identifikácia calcyphosinu a stathminu-1 ako markerov agresivity nádorov endometria s odlišnou špecifitou |
|---|
| M 05: M. Běhounek – Proteomická analýza myokardu při levostranném a oboustranném srdečním selhání |
|---|
| 17:00 – 17:20 | Přestávka na kávu |
|---|
| 17:20 – 18:40 | Přednášková sekce II + 2 miniprezentace (Předsedající: P. Novák) |
|---|
| 17:20 – 17:35 | P 05: K. Harant – Kapacita Orbitrapu - citlivost a úspěšnost identifikace peptidů |
|---|
| 17:35 – 17:50 | P 06: D. Potěšil – Softwarový kontejner a nové KNIME komponenty pro procesování proteomických dat |
|---|
| 17:50 – 18:05 | P 07: M. Hubálek – Využití nástrojů z otevřených zdrojů při vyhodnocení proteomických experimentů |
|---|
| 18:05 – 18:20 | P 08: G. Lochmanová – Vliv genetického a chemického utlumení histondeacetyláz na vývoj rostlin a modifikační profil histonů |
|---|
| 18:20 – 18:30 | M 06: J. Tylečková – Vliv duplicit v prasečí databázi na vyhodnocení SWATH dat |
|---|
| 18:30 – 18:40 | M 07: J. Novák – A FASP protocol optimisation of protein extraction from small extracellular vesicles for proteomic analysis by LC-MS/MS |
|---|
| 18:40 – 18:50 | Vyhlášení vítěze Ceny Josefa Chmelíka za publikace z let 2017 a 2018 (J. Petrák) |
|---|
| 18:50 – 19:10 | Oceněný 2017 |
|---|
| 19:10 – 19:30 | Oceněný 2018 |
|---|
| 19:30 – 22:00 | Večeře a neformální diskuse v Pevnosti poznání |
|---|
Sobota, 30. listopadu 2019, 9:15 – 14:30
| 9:15 – 10:30 | Přednášková sekce III (Předsedající: P. Bouchal) |
|---|
| 9:15 – 9:30 | P 09: P. Novák – Nativní MS a jeho využití pro sledování interakce mezi transkripčním faktorem a odpovídající DNA sekvencí |
|---|
| 9:30 – 9:45 | P 10: G. Kruppa – 4-D Proteomics and diaPASEF: Combining trapped ion mobility (TIMS) and PASEF with data independent analysis |
|---|
| 9:45 – 10:00 | P 11: M. Černý – Změny proteomu v průběhu klíčení |
|---|
| 10:00 – 10:15 | P 12: D. Petráčková – Paralelní transkriptomická a proteomická analýza makrofágů THP-1 infikovaných lidským patogenem Bordetella pertussis |
|---|
| 10:15 – 10:30 | P 13: P. Junková – Povrchové mapování retrovirových proteinů vázaných na fosfolipidovou membránu |
|---|
| 10:30 – 10:50 | Přestávka na kávu |
|---|
| 10:50 – 12:10 | Miniprezentace – blok 2 (Předsedající: J. Petrák) |
|---|
| M 08: E. Strouhalová – In vitro fosforylace rekombinantních proteinů |
|---|
| M 09: H. Kuchaříková – Optimalizace metody analýzy acetylomu |
|---|
| M 10: M. Vrbacký – Komplexomové profilování mitochondriálních (super)komplexů |
|---|
| M 11: J. Červenka – Proteomic analyses of neural stem cells differentiation in in vitro conditions |
|---|
| M 12: P. Bouchal – DDA, DIA, či directDIA: závisle, s knihovnou či bez? Praktické porovnání přístupů pro různé typy proteomických experimentů |
|---|
| M 13: P. Lapčík – Globální analýza NF-κB proteinových komplexů v modelu luminálních A nádorů prsu pomocí SEC-LC-MS/MS |
|---|
| M 14: R. Mucha – Identifikácia zmien zloženia proteómu počas ischémie a v skorej fáze reperfúzie na základe analýzy krvnej plazmy |
|---|
| M 15: P. Řehulka – Frakcionace peptidů pro proteomickou analýzu |
|---|
| 12:10 – 12:20 | Fyziologická přestávka |
|---|
| 12:20 – 13:20 | Miniprezentace – blok 3 (Předsedající: P. Řehulka) |
|---|
| M 16: Š. Czornyj – Proteomika ve službách úřední kontroly potravin |
|---|
| M 17: M. Berka – Studium biotických interakcí rostlin pomocí omické analýzy |
|---|
| M 18: A. Křenková – Detekce interakčních partnerů proteinu HBx viru hepatitidy B |
|---|
| M 19: J. Držmíšek – Identifikace imunogenních antigenů Bordetella pertussis |
|---|
| M 20: V. Vozandychová – Analýza deubikvitinačních enzymů v procesu infekce bakterií Francisella tularensis |
|---|
| M 21: R. Tuzhilkin – Azurin (elektron-transportní cupredoxin): model pro studium přenosu elektronu a oligomerizace proteinů |
|---|
| M 22: M. Šebela – Analýza působení enzymových inhibitorů pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie |
|---|
| 13:20 – 14:30 | Ukončení konference a oběd v Pevnosti poznání |
|---|
